慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)

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KAKEN_26600055seika  
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KAKEN_26600055seika.pdf
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Release Date
 
Title
Title シリコンナノポアを用いた光学検出による一分子DNAの塩基配列情報解読  
Kana シリコン ナノポア オ モチイタ コウガク ケンシュツ ニ ヨル イチブンシ DNA ノ エンキ ハイレツ ジョウホウ カイドク  
Romanization Shirikon nanopoa o mochiita kogaku kenshutsu ni yoru ichibunshi DNA no enki hairetsu joho kaidoku  
Other Title
Title Optical detection of single DNA molecules using a silicon nanopore for readout of sequence information  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 斎木, 敏治  
Kana サイキ, トシハル  
Romanization Saiki, Toshiharu  
Affiliation 慶應義塾大学・理工学部・教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 70261196

Name 岩崎, 渉  
Kana イワサキ, ワタル  
Romanization Iwasaki, Wataru  
Affiliation 東京大学・大学院理学系研究科・准教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team member  
Link 科研費研究者番号 : 50545019
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2016  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2015  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
ナノポアシーケンサにおいて高精度な塩基識別実現に向けた課題は, 通過速度の低速化と安定化である。そのためには, ナノポア通過直前・直後のDNAの形態やそれに依存したドリフト運動と拡散運動の競合等を明らかにする必要がある。本研究では, ナノポア通過中, ならびに通過後のDNAコイル形成と空間的移動の観測に必要な100nm, 0.1msの空間・時間分解能を有する光学的観察手法の開発, 動作実証をおこない, さらにナノポア近傍の電場に起因する特徴的なDNA通過挙動を見出した。また塩基情報解読に向けてSTED利用の有効性を確認し, プラズモニック・ナノポアの作製に成功した。
The challenge in highly accurate identification of each nucleotide is slowing and stabilizing DNA translocation velocity. For this purpose, DNA conformation and drift-diffusion motion immediately before and after translocation should be investigated. In this study, an optical microscopic method with 100-nm and 0.1-ms resolution is developed to observe DNA coiling immediately after translocation and its motion. Characteristic DNA translocation dynamics caused by the electric field in the vicinity of nanopore exit is obtained and the mechanism is discussed in detail. To achieve higher spatial resolution aiming to single-molecule sequencing, the possibility of combination with STED and plasmonic nanopore is also demonstrated.
 
Table of contents

 
Keyword
ナノポアセンシング  

DNA  

蛍光計測  

プラズモン  
NDC
 
Note
研究種目 : 挑戦的萌芽研究
研究期間 : 2014~2015
課題番号 : 26600055
研究分野 : ナノ光学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
131.113.194.249
Access conditions

 
Last modified date
Dec 27, 2016 11:19:07  
Creation date
Dec 27, 2016 11:19:07  
Registerd by
mediacenter
 
History
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2015 / Japan Society for the Promotion of Science
 
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