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KAKEN_17KK0146seika  
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本文公開日
 
タイトル
タイトル 細菌型sRNAにおけるHfq結合領域の構造原理の解明  
カナ サイキンガタ sRNA ニ オケル Hfq ケツゴウ リョウイキ ノ コウゾウ ゲンリ ノ カイメイ  
ローマ字 Saikingata sRNA ni okeru Hfq ketsugō ryōiki no kōzō genri no kaimei  
別タイトル
名前 Structural basis of functional Hfq-binding region of bacterial sRNA  
カナ  
ローマ字  
著者
名前 森田, 鉄兵  
カナ モリタ, テッペイ  
ローマ字 Morita, Teppei  
所属 慶應義塾大学・政策・メディア研究科 (藤沢) ・特任講師  
所属(翻訳)  
役割 Research team head  
外部リンク 科研費研究者番号 : 10444366

名前 Gottesman, Susan  
カナ ゴッテスマン, スーザン  
ローマ字  
所属 National Institutes of Health・National Cancer Institute・Chief, Laboratory of Molecular Biology  
所属(翻訳)  
役割 Collaborator  
外部リンク  

名前  
カナ  
ローマ字  
所属  
所属(翻訳)  
役割  
外部リンク  
 
出版地
 
出版者
名前  
カナ  
ローマ字  
日付
出版年(from:yyyy) 2022  
出版年(to:yyyy)  
作成日(yyyy-mm-dd)  
更新日(yyyy-mm-dd)  
記録日(yyyy-mm-dd)  
形態
1 pdf  
上位タイトル
名前 科学研究費補助金研究成果報告書  
翻訳  
 
 
2021  
 
開始ページ  
終了ページ  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII論文ID
 
医中誌ID
 
その他ID
 
博士論文情報
学位授与番号  
学位授与年月日  
学位名  
学位授与機関  
抄録
sRNAの機能構造や合成機構の原理の解明を目的として、sRNAの転写終結の解析や転写終結を制御する遺伝因子の探索を行った。sRNAの1つであるSgrSの転写終結を用いたスクリーニングにより、sRNAの転写終結やその制御系を破綻させる新規因子を同定した。これにより、sRNAの転写終結がsRNA制御系の新たな調節階層であるという概念を提示する。さらに、新規因子の1つであるCspDの過剰発現下で、転写伸長制御エレメント(リボスイッチ等)が一手に破綻するという現象をRNA-Seqにより捉えた。これにより、sRNAの合成制御に加え、CspDによる転写伸長制御のゲノムレベルでの役割が示唆された。
This project focuses on structural features of the 3’end of bacterial sRNA and the mechanism of sRNA production via transcription termination. We investigated the termination efficiencies of some sRNAs and carried out a multicopy plasmid screen in E. coli to look for genetic factors by which the termination of sRNAs could be modulated. We identified novel factors that attenuate the termination of SgrS sRNA. Biochemical analyses showed effects of each factor on both the termination of sRNAs and the regulation by SgrS of the target mRNAs. These results confirm changes in the efficiency of intrinsic termination as an additional layer of the regulation of sRNA signaling. In addition, RNA-Seq analysis found global effects of CspD, which is one of the isolated factors, on transcription across some regulatory termination sites, such as Riboswithes. This suggests that CspD plays a global regulator in transcription elongation/termination.
 
目次

 
キーワード
小分子RNA  

遺伝子発現  

転写終結  

Hfq  

細菌  

低温ショックタンパク質  

Rho  
NDC
 
注記
研究種目 : 国際共同研究加速基金 (国際共同研究強化)
研究期間 : 2017~2021
課題番号 : 17KK0146
研究分野 : 分子生物学
 
言語
日本語  

英語  
資源タイプ
text  
ジャンル
Research Paper  
著者版フラグ
publisher  
関連DOI
アクセス条件

 
最終更新日
Dec 23, 2024 15:20:21  
作成日
Dec 23, 2024 15:20:21  
所有者
mediacenter
 
更新履歴
Dec 23, 2024    インデックス を変更
 
インデックス
/ Public / 科学研究費補助金研究成果報告書 / 2021年度 / 日本学術振興会
 
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