慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

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ID
KAKEN_17K07517seika  
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KAKEN_17K07517seika.pdf
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Size :1.1 MB
Last updated :Mar 5, 2021
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Release Date
 
Title
Title 多様性を有するRNAキナーゼの進化情報解析とその情報に基づいた酵素機能の改変  
Kana タヨウセイ オ ユウスル RNA キナーゼ ノ シンカ ジョウホウ カイセキ ト ソノ ジョウホウ ニ モトズイタ コウソ キノウ ノ カイヘン  
Romanization Tayōsei o yūsuru RNA kināze no shinka jōhō kaiseki to sono jōhō ni motozuita kōso kinō no kaihen  
Other Title
Title Molecular evolution of diverse RNA kinase family proteins and construction of mutant enzymes based on the evolutionary data  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 金井, 昭夫  
Kana カナイ, アキオ  
Romanization Kanai, Akio  
Affiliation 慶應義塾大学・環境情報学部 (藤沢) ・教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 60260329
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2020  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2019  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以上の巨大なClp1関連タンパク質を122個検出した。さらに、Thermus scotoductus Clp1組換え体酵素を用いて、バクテリアClp1のリン酸化活性を世界で初めて実験科学的に検証した。
We conducted a large-scale molecular evolutionary analysis of the Clp1 family proteins, a polyribonucleotide 5'-hydroxyl kinases. In total, 3,557 Clp1 family proteins were detected in the three domains of life, Bacteria, Archaea, and Eukarya. Many were from Archaea and Eukarya, but a few were found in restricted, phylogenetically diverse bacterial species. The domain structures of the Clp1 family proteins also differed among the three domains of life. Although the proteins were, on average, 555 amino acids long (range, 196-2,728), 122 large proteins with > 1,000 amino acids were detected in eukaryotes. The polyribonucleotide kinase activity of Thermus scotoductus Clp1 was characterized experimentally. We propose a comprehensive assessment of the diversification of the Clp1 family proteins and the molecular evolution of their functional domains.
 
Table of contents

 
Keyword
分子進化  

ポリヌクレオチドリン酸化酵素  

情報学的解析  

実験検証  

巨大タンパク質  
NDC
 
Note
研究種目 : 基盤研究 (C) (一般)
研究期間 : 2017~2019
課題番号 : 17K07517
研究分野 : 分子進化学、分子生物学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
131.113.194.249
Access conditions

 
Last modified date
Mar 05, 2021 13:23:37  
Creation date
Mar 05, 2021 13:23:37  
Registerd by
mediacenter
 
History
Mar 5, 2021    インデックス を変更
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2019 / Japan Society for the Promotion of Science
 
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