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KAKEN_22860056seika  
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本文公開日
 
タイトル
タイトル 大腸菌の代謝・遺伝子発現の統合モデルの開発  
カナ ダイチョウキン ノ タイシャ・イデンシ ハツゲン ノ トウゴウ モデル ノ カイハツ  
ローマ字 Daichokin no taisha idenshi hatsugen no togo moderu no kaihatsu  
別タイトル
名前 Development of gene expression-metabolic model of Escherichia coli  
カナ  
ローマ字  
著者
名前 戸谷, 吉博  
カナ トヤ, ヨシヒロ  
ローマ字 Toya, Yoshihiro  
所属 慶應義塾大学・政策・メディア研究科・特任助教  
所属(翻訳)  
役割 Research team head  
外部リンク 科研費研究者番号 : 70582162
 
出版地
 
出版者
名前  
カナ  
ローマ字  
日付
出版年(from:yyyy) 2012  
出版年(to:yyyy)  
作成日(yyyy-mm-dd)  
更新日(yyyy-mm-dd)  
記録日(yyyy-mm-dd)  
形態
1 pdf  
上位タイトル
名前 科学研究費補助金研究成果報告書  
翻訳  
 
 
2011  
 
開始ページ  
終了ページ  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII論文ID
 
医中誌ID
 
その他ID
 
博士論文情報
学位授与番号  
学位授与年月日  
学位名  
学位授与機関  
抄録
細胞の代謝は転写、翻訳、酵素反応のレベルで制御されており、これらの複数の階層に跨ってどのように代謝が調節されているのかは大変興味深い。私は大腸菌の野生株や⊿arcA株(硝酸条件)を複数の培養条件で連続培養し、トランスクリプトーム、メタボローム、代謝フラックスを測定し、それぞれの調節機構を明らかにした。また、測定したマルチオミックスデータを構築した動的モデルを使って統合することで動的モデルのチューニングを実施し、⊿arcA株の遺伝子発現比を元にシミュレーションしたところ、予測された反応速度は実測フラックスとほぼ一致することを示した。異なる階層のオミックスデータを統合し、細胞内の調節機構を解明するためのプラットフォームとしての有用性を示すことができた。
 
目次

 
キーワード
大腸菌  

中心炭素代謝経路  

動的シミュレーション  

代謝フラックス解析  

トランスクリプトーム  

硝酸代謝  

メタボローム  

arcA遺伝子欠損株  
NDC
 
注記
研究種目 : 研究活動スタート支援
研究期間 : 2010~2011
課題番号 : 22860056
研究分野 : 工学
科研費の分科・細目 : プロセス工学・ 生物機能・バイオプロセス
 
言語
日本語  
資源タイプ
text  
ジャンル
Research Paper  
著者版フラグ
publisher  
関連DOI
アクセス条件

 
最終更新日
Oct 16, 2012 09:00:00  
作成日
Oct 16, 2012 09:00:00  
所有者
mediacenter
 
更新履歴
 
インデックス
/ Public / 科学研究費補助金研究成果報告書 / 2011年度 / 日本学術振興会
 
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