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2021000003-20210277  
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本文公開日
 
タイトル
タイトル がんビッグデータ解析による遺伝学的素因が体細胞異常プロファイルに与える影響の解明  
カナ ガン ビッグ データ カイセキ ニ ヨル イデンガクテキ ソイン ガ タイサイボウ イジョウ プロファイル ニ アタエル エイキョウ ノ カイメイ  
ローマ字 Gan biggu dēta kaiseki ni yoru idengakuteki soin ga taisaibō ijō purofairu ni ataeru eikyō no kaimei  
別タイトル
名前 Effect of common germline risk on somatic alterations in human cancers  
カナ  
ローマ字  
著者
名前 片岡, 圭亮  
カナ カタオカ, ケイスケ  
ローマ字 Kataoka, Keisuke  
所属 慶應義塾大学医学部臨床教室教授  
所属(翻訳)  
役割 Research team head  
外部リンク  
 
出版地
 
出版者
名前 慶應義塾大学  
カナ ケイオウ ギジュク ダイガク  
ローマ字 Keiō gijuku daigaku  
日付
出版年(from:yyyy) 2022  
出版年(to:yyyy)  
作成日(yyyy-mm-dd)  
更新日(yyyy-mm-dd)  
記録日(yyyy-mm-dd)  
形態
1 pdf  
上位タイトル
名前 学事振興資金研究成果実績報告書  
翻訳  
 
 
2021  
 
開始ページ  
終了ページ  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII論文ID
 
医中誌ID
 
その他ID
 
博士論文情報
学位授与番号  
学位授与年月日  
学位名  
学位授与機関  
抄録
Polygenic risk score (PRS)などの生殖細胞系列リスクの集合は、がんの遺伝学的感受性を説明可能である。しかし、このような生殖細胞系列リスクが体細胞異常や臨床因子に与える影響は明らかではない。本研究では、12種類のがん種における14個のgenome-wide association study (GWAS、中央値64,905例)から様々な手法を用いてPRSを作成し、UK Biobank (UKB、335,048例)のデータを用いて、最適なPRSを同定した。さらに、The Cancer Genome Atlas (TCGA、7,965例)データを用いて、PRSと体細胞異常や臨床因子との関係についてメタ解析を実施した。その結果、PRS高値が、早期のがん発症、および、総変異数およびコピー数異常数の増加と関連することが明らかになった。一方、稀な生殖細胞系列の病的バリアント(BRCA1/2バリアント)は、これらの項目と一貫した関係を示さなかった。我々の結果は、生殖細胞系列リスクが高い場合、がん発生・進展の後期に特徴的な多彩な体細胞異常の蓄積が起こる前に腫瘍が発症することを促す可能性を示唆している。
Aggregation of genome-wide common risk variants, such as polygenic risk score (PRS), can explain germline genetic liability to cancer. However, it remains unknown how common germline variants associate with somatic alterations and clinical features. We constructed PRSs from 14 genome-wide association studies (GWASs) (median n = 64,905) for 12 cancer types by multiple methods and calibrated them using the UK Biobank (UKB) resources (n = 335,048). Meta-analyses of the PRS associations across cancer types in The Cancer Genome Atlas (TCGA) (n = 7,965) revealed that a higher PRS was significantly associated with earlier cancer onset and lower burden of somatic alterations, including total mutations, chromosome/arm somatic copy number alterations (SCNAs), and focal SCNAs. This contrasts with rare germline pathogenic variants (e.g., BRCA1/2 variants), showing heterogeneous associations with somatic alterations. Our results suggest that increased cancer common germline risks allow early tumor development before the accumulation of many somatic alterations characteristic of later stages of carcinogenesis.
 
目次

 
キーワード
 
NDC
 
注記

 
言語
日本語  

英語  
資源タイプ
text  
ジャンル
Research Paper  
著者版フラグ
publisher  
関連DOI
アクセス条件

 
最終更新日
Feb 16, 2024 14:10:47  
作成日
Feb 16, 2024 14:10:47  
所有者
mediacenter
 
更新履歴
Feb 16, 2024    インデックス を変更
 
インデックス
/ Public / 塾内助成報告書 / 学事振興資金研究成果実績報告書 / 2021年度
 
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