慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)

ホーム  »»  アイテム一覧  »»  アイテム詳細

アイテム詳細

アイテムタイプ Article
ID
KO12003001-00002020-0050  
プレビュー
画像
thumbnail  
キャプション  
本文
KO12003001-00002020-0050.pdf
Type :application/pdf Download
Size :117.6 KB
Last updated :Mar 28, 2022
Downloads : 184

Total downloads since Mar 28, 2022 : 184
 
本文公開日
 
タイトル
タイトル 難治性前立腺癌のシングルセル解析によるゲノムエピゲノム進化と腫瘍内不均一性の解明  
カナ ナンチセイ ゼンリツセンガン ノ シングル セル カイセキ ニ ヨル ゲノム エピゲノム シンカ ト シュヨウナイ フキンイツセイ ノ カイメイ  
ローマ字 Nanchisei zenritsusengan no shinguru seru kaiseki ni yoru genomu epigenomu shinka to shuyōnai fukin'itsusei no kaimei  
別タイトル
名前 Analysis of genome and epigenome evolution and tumor heterogeneity by single cell analysis in drug resistant prostate cancer  
カナ  
ローマ字  
著者
名前 小坂, 威雄  
カナ コサカ, タケオ  
ローマ字 Kosaka, Takeo  
所属 慶應義塾大学医学部臨床教室  
所属(翻訳)  
役割 Research team head  
外部リンク  
 
出版地
 
出版者
名前 福澤基金運営委員会  
カナ フクザワ キキン ウンエイ イインカイ  
ローマ字 Fukuzawa kikin un'ei iinkai  
日付
出版年(from:yyyy) 2021  
出版年(to:yyyy)  
作成日(yyyy-mm-dd)  
更新日(yyyy-mm-dd)  
記録日(yyyy-mm-dd)  
形態
1 p.  
上位タイトル
名前 福澤諭吉記念慶應義塾学事振興基金事業報告集  
翻訳  
 
 
2020  
 
開始ページ  
終了ページ  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII論文ID
 
医中誌ID
 
その他ID
 
博士論文情報
学位授与番号  
学位授与年月日  
学位名  
学位授与機関  
抄録
流体力学を応用した次世代の新規CTC回収システムで、実際に数百から数千の生きた状態のCTC回収が可能である。薬剤耐性CRPCや NEPCのように上皮性マーカーの発現が乏しいがんにおいてもCTC研究を加速化させる革新性を有している。シングルセル解析のプラットフォームとしては分割能が優れ、RNAが分解される前に短時間で処理可能で、同時に処理可能なサンプルが多いという特徴を有する10×Genomics社のChromium single cellをライブラリー調整システムを使用したプラットフォームでCTCのシングルセルRNAシーケンス解析する。薬剤耐性前立腺癌患者4名から、流体力学を応用した次世代新規CTC回収システム(Clear Cell FX system)を応用し、ラベルフリーにより数百から数千の生きた状態のCTC回収した。CTC回収したのちに、速やかにChromium社のNGS前処理装置を用いてシングルセル化した上で、分子バーコードを付与しIllumina社NGSを用いてRNA-seq解析を実施した。薬剤に対して感受性を有する患者群と、初回耐性を有する患者群のCTCのなかに明らかに初回耐性に関連すると分別できるクラスターを見出した(論文投稿準備中)。現在これらの候補クラスターの因子の発現、機能解析について検討を進めている。
It is a next-generation new CTC collecting system that applies fluid dynamics, and can actually recover hundreds to thousands of live CTCs. The system also has the innovation to accelerate CTC research in cancers with poor expression of epithelial markers, such as drug-resistant CRPC and NEPC. A library adjustment system for 10 × Genomics Chromium single cells, which has excellent partitioning ability as a platform for single cell analysis, can be processed in a short time before RNA is degraded, and many samples can be processed at the same time. Single-cell RNA sequencing of CTCs on a platform using. Hundreds to thousands of live CTCs were recovered label-free from four drug-resistant prostate cancer patients by applying the next-generation new CTC collecting system (Clear Cell FX system) that applied fluid dynamics. After CTC collecting, the cells were immediately converted into single cells using an NGS pretreatment device manufactured by Chromium, and then subjected to RNA-seq analysis using NGS manufactured by Illumina with a molecular barcode. We found a cluster in the CTCs of the group of patients who were sensitive to the drug and the group of patients who had initial resistance that could be clearly distinguished as related to initial resistance (preparation for submission of paper). Currently, we are studying the expression and functional analysis of the factors of these candidate clusters.
 
目次

 
キーワード
 
NDC
 
注記
申請種類 : 福澤基金研究補助
 
言語
日本語  

英語  
資源タイプ
text  
ジャンル
Research Paper  
著者版フラグ
publisher  
関連DOI
アクセス条件

 
最終更新日
Mar 28, 2022 10:40:44  
作成日
Mar 28, 2022 10:40:44  
所有者
mediacenter
 
更新履歴
Mar 28, 2022    インデックス を変更
 
インデックス
/ Public / 塾内助成報告書 / 福澤諭吉記念慶應義塾学事振興基金事業報告集 / 2020年度
 
関連アイテム
 

ランキング

最も多く閲覧されたアイテム
1位 二〇二三年度三田... (613) 1st
2位 新自由主義に抗す... (410)
3位 731部隊と細菌戦 ... (238)
4位 斎藤隆夫の「粛軍... (233)
5位 認知文法から考え... (190)

最も多くダウンロードされたアイテム
1位 731部隊と細菌戦 ... (446) 1st
2位 新参ファンと古参... (431)
3位 日本における美容... (326)
4位 新自由主義に抗す... (299)
5位 インフルエンサー... (257)

LINK

慶應義塾ホームページへ
慶應義塾大学メディアセンターデジタルコレクション
慶應義塾大学メディアセンター本部
慶應義塾研究者情報データベース