慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

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ID
KAKEN_25830134seika  
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KAKEN_25830134seika.pdf
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Release Date
 
Title
Title 転移因子を抑制する新規小分子RNA機能の解析  
Kana テンイ インシ オ ヨクセイスル シンキ ショウブンシ RNA キノウ ノ カイセキ  
Romanization Teni inshi o yokuseisuru shinki shobunshi RNA kino no kaiseki  
Other Title
Title Identification and characterization of transposable element-regulating small RNAs  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 岩崎, 由香  
Kana イワサキ, ユカ  
Romanization Iwasaki, Yuka  
Affiliation 慶應義塾大学・医学部・助教  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 80612647
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2015  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2014  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
霊長類生殖組織における小分子RNAを介したトランスポゾンの発現抑制に関しては未知の部分が大きい。そこで, 霊長類モデル生物マーモセットの小分子RNAを次世代シーケンサにより網羅的に解析した。その結果, マーモセット精巣において, トランスポゾン領域由来の新規miRNAなどを同定すると同時に, 発現している小分子RNAの大部分がpiRNAに占められていることを見いだした。piRNAについて詳細な解析を進めたところ, 多くがトランスポゾン類似配列やトランスポゾン自身に由来していた。さらに, トランスポゾンの転移能と発現するpiRNA量などの特徴を解析し, piRNAによるトランスポゾン抑制モデルを提唱した。
Small RNAs mediate transposable element (TE) silencing by binding Argonaute/Piwi proteins. Here, we describe small RNA profiling of the adult testes of Callithrix jacchus, a model primate. We identified 353 novel miRNAs, which some originated from TEs. Meanwhile, the most abundant class of small RNAs in the adult testis was piRNAs. Therefore, we generated an antibody for MARWI, a marmoset PIWI protein, and performed high throughput sequencing analysis. MARWI-piRNAs show characteristics of mouse pachytene piRNAs, and are mostly derived from conserved clustered regions in the genome, known as pIRNA clusters. Further analysis revealed that strand bias observed for piRNAs mapped to each TE subfamily correlates with the polarity of TE copies inserted in clusters. Also, more piRNAs map to TE subfamilies when they have copies in piRNA clusters. These findings suggest that TE insertions to pachytene piRNA clusters determine abundance and strand-bias of TE-derived piRNAs.
 
Table of contents

 
Keyword
小分子RNA  

トランスポゾン  

遺伝子発現抑制  

生殖組織  

非コードRNA  

RNAサイレンシング  
NDC
 
Note
研究種目 : 若手研究(B)
研究期間 : 2013~2014
課題番号 : 25830134
研究分野 : 分子生物学, ゲノム生物学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
131.113.194.249
Access conditions

 
Last modified date
Aug 02, 2019 10:21:03  
Creation date
Apr 11, 2016 09:45:51  
Registerd by
mediacenter
 
History
Aug 2, 2019    著者,抄録 内容,本文URI URI を変更
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2014 / Japan Society for the Promotion of Science
 
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