慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)

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ID
KAKEN_24310148seika  
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KAKEN_24310148seika.pdf
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Release Date
 
Title
Title mRNAと新生ペプチドの局所構造による翻訳効率変化のゲノムワイド解析  
Kana mRNA ト シンセイ ペプチド ノ キョクショ コウゾウ ニ ヨル ホンヤク コウリツ ヘンカ ノ ゲノム ワイド カイセキ  
Romanization mRNA to shinsei pepuchido no kyokusho kozo ni yoru honyaku koritsu henka no genomu waido kaiseki  
Other Title
Title Genome wide analysis of translation efficiency by local structure of mRNA and nascent peptide  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 中東, 憲治  
Kana ナカヒガシ, ケンジ  
Romanization Nakahigashi, Kenji  
Affiliation 慶應義塾大学・政策・メディア研究科・特任准教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 70322740

Name 森, 浩禎  
Kana モリ, ヒロタダ  
Romanization Mori, Hirotada  
Affiliation 奈良先端科学技術大学院大学・バイオサイエンス研究科・教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team member  
Link 科研費研究者番号 : 90182203

Name 金井, 昭夫  
Kana カナイ, アキオ  
Romanization Kanai, Akio  
Affiliation 慶應義塾大学・環境情報学部・教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team member  
Link 科研費研究者番号 : 60260329
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2015  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2014  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
遺伝子mRNAからタンパク質が翻訳される状況を新しい実験手法で解析し, ゲノム全体の遺伝子を見た場合, 翻訳開始の構造が翻訳の効率に大きな影響を与えることを明らかにした。対して, 翻訳伸長の効率にも差はあったが, 遺伝子全体の翻訳効率に大きな影響は与えていなかった。また, コドン-アンチコドンの3文字目の認識や, small RNA/Hfqによる翻訳制御の実体など, ネイティブな翻訳関連因子の性質についてや, 様々な抗生物質の作用機序など, これまで知られていなかった性質を示す新たな知見を得た。
We performed genome wide analysis of efficiency in mRNA translation to protein, employing new method. We experimentally showed that rate of initiation largely affected the overall efficiency of a gene, while difference in elongation efficiency by codon usage did exist but the effect was much smaller.
We also found new insights in the nature of translation apparatus and factors, such as efficiency of non-canonical codon-anticodon recognition at 3rd letter and translational regulation by sRNA/Hfq, as well as effect of nascent-peptide sequence on specificity of various antibiotics.
 
Table of contents

 
Keyword
リボソームプロファイリング  

ゲノム解析技術  

リボソーム  

翻訳  

翻訳制御  

コドン  
NDC
 
Note
研究種目 : 基盤研究(B)
研究期間 : 2012~2014
課題番号 : 24310148
研究分野 : システム生物学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
131.113.194.249
Access conditions

 
Last modified date
Apr 11, 2016 10:05:08  
Creation date
Apr 11, 2016 10:05:08  
Registerd by
mediacenter
 
History
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2014 / Japan Society for the Promotion of Science
 
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