本研究は、まず腸管組織障害エントロピー研究の障害であるモデル動物の欠如を埋めるため、腸管上皮剥離による腸管線維化モデルを樹立することに成功した。樹立した新規腸管線維化モデル動物とヒト検体を用いて、腸管におけるストローマ細胞のbulk RNA-seqおよびscRNA-seqデータをバイアスのかからない条件で解析し、腸管常在性のストローマ細胞の機能的多様性を明らかにした。さらに、ATAC-seqなどのエピゲノム解析との統合マルチオミックス解析を用いた検討より、腸管線維化に特異的に出現する線維芽細胞集団を同定し、遺伝子発現プロファイルがエピゲノムレベルで制御されていることを明らかにした。
In this study, we successfully established an intestinal fibrosis model induced by intestinal epithelial detachment to address the lack of model animals in the research of intestinal tissue remodeling or increase in entropy. Using the newly established intestinal fibrosis model animals and human samples, we conducted unbiased analyses of bulk RNA-seq and scRNA-seq data of stromal cells in the intestine, revealing the functional diversity of intestinal resident stromal cells. Furthermore, through integrative multi-omics analysis incorporating transcriptomic and epigenomic analyses such as ATAC-seq, we identified a novel fibroblast population that specifically arises during intestinal fibrosis.

研究種目 : 学術変革領域研究 (B)
研究期間 : 2021～2023
課題番号 : 21H05123
研究分野 : 消化器病学