がんゲノム医療推進のため、クリニカルシークエンスが保険適応となったが、DNA情報に加え、RNA情報・エピジェネティック情報等を同一検体から収集して多層データを構築し、腫瘍の全体像を統合的に捉える次世代型クリニカルシークエンスが求められている。これら情報の理解は容易ではないが、医療者の持つ知識に異存せず、馴染みのある思考法に沿うような環境を作り出すため、臨床情報・ゲノム情報・遺伝子発現情報を視覚的に解析可能な統合解析プラットフォームの開発を施行した。自然言語処理を用いた診療録の構造化システムの開発を行い、がんゲノム医療に必須の臨床情報を効率的かつ永続的に付加する基盤の構築を行った。
Clinical sequencing is now covered by insurance to promote cancer precision medicine. In addition to DNA, RNA, and clinical information are collected from the same specimen to construct omics data, and next-generation clinical sequencing is required to obtain an integrated portrait of the entire tumor. Understanding this information is not easy, but in order to create an environment that is not alien to the knowledge possessed by medical professionals and that follows a familiar way of thinking, we have developed an integrated analysis platform that enables visual analysis of clinical information, genomic data, and gene expression data. We developed a system for structuring medical records using natural language processing, and constructed a platform for efficiently and permanently adding clinical information essential for cancer precision medicine.

研究種目 : 基盤研究 (B) (一般)
研究期間 : 2020～2022
課題番号 : 20H03747
研究分野 : 消化器癌・乳癌