慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

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KAKEN_18K17394seika  
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KAKEN_18K17394seika.pdf
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Release Date
 
Title
Title 腎機能低下を早期に予測するメタボロミクス・バイオマーカーの解明と予防医療への展開  
Kana ジンキノウ テイカ オ ソウキ ニ ヨソクスル メタボロミクス・バイオマーカー ノ カイメイ ト ヨボウ イリョウ エノ テンカイ  
Romanization Jinkinō teika o sōki ni yosokusuru metaboromikusu baiomākā no kaimei to yobō iryō eno tenkai  
Other Title
Title Metabolomics biomarkers for predicting renal function decline  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 原田, 成  
Kana ハラダ, セイ  
Romanization Harada, Sei  
Affiliation 慶應義塾大学・医学部 (信濃町) ・講師  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 10738090
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2021  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2020  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
60-74歳の一般市民1,672人に対し、調査開始時の腎機能測定(血清クレアチニン、血清シスタチンC、尿中アルブミン)と血漿・尿メタボローム測定を行った。また同じ参加者に対して、6年後も同様に評価した。
機械学習的手法(OPLS-DA)を用いて、6年間での腎機能低下を予測した結果、古典的な腎機能指標に加えて、血漿・尿メタボロームを用いることで、より正確な予測モデルが構築できた。さらに別の機械学習的手法(SVM)を用いてROCカーブを作成したところ、3種類の代謝物を含む上位5つの変数を選択した場合にもっとも精度が高く、AUC 0.904(95%CI 0.871-0.944)と好成績であった。
Renal function measurements (serum creatinine, serum cystatin C, and urine albumin) and plasma and urine metabolomics were performed on 1,672 participants aged 60-74 years at the beginning of the study. The same participants were also evaluated in the same way after 6 years.
A machine learning method (OPLS-DA) was used to predict the decline in renal function over 6 years, and a more accurate prediction model was constructed by using plasma and urine metabolome in addition to classical renal function indicators. Furthermore, another machine-learning approach (SVM) was used to create ROC curves, which were most accurate when the top five variables including three metabolites were selected, with a good performance of AUC 0.904 (95%CI 0.871-0.944).
 
Table of contents

 
Keyword
腎機能低下  

メタボローム  

機械学習  

予防医学  

慢性腎臓病  
NDC
 
Note
研究種目 : 若手研究
研究期間 : 2018~2020
課題番号 : 18K17394
研究分野 : メタボロミクス疫学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
Related DOI
Access conditions

 
Last modified date
May 17, 2022 13:23:31  
Creation date
May 17, 2022 13:23:31  
Registerd by
mediacenter
 
History
May 17, 2022    インデックス を変更
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2020 / Japan Society for the Promotion of Science
 
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