慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)KeiO Associated Repository of Academic resources

慶應義塾大学学術情報リポジトリ(KOARA)

Home  »»  Listing item  »»  Detail

Detail

Item Type Article
ID
KAKEN_17K10855seika  
Preview
Image
thumbnail  
Caption  
Full text
KAKEN_17K10855seika.pdf
Type :application/pdf Download
Size :680.4 KB
Last updated :Mar 5, 2021
Downloads : 340

Total downloads since Mar 5, 2021 : 340
 
Release Date
 
Title
Title 脳腫瘍クリニカルシークエンスの基盤作成  
Kana ノウシュヨウ クリニカル シークエンス ノ キバン サクセイ  
Romanization Nōshuyō kurinikaru shīkuensu no kiban sakusei  
Other Title
Title Clinical sequence platform for brain tumor  
Kana  
Romanization  
Creator
Name 西原, 広史  
Kana ニシハラ, ヒロシ  
Romanization Nishihara, Hiroshi  
Affiliation 慶應義塾大学・医学部 (信濃町) ・教授  
Affiliation (Translated)  
Role Research team head  
Link 科研費研究者番号 : 50322805
Edition
 
Place
 
Publisher
Name  
Kana  
Romanization  
Date
Issued (from:yyyy) 2020  
Issued (to:yyyy)  
Created (yyyy-mm-dd)  
Updated (yyyy-mm-dd)  
Captured (yyyy-mm-dd)  
Physical description
1 pdf  
Source Title
Name 科学研究費補助金研究成果報告書  
Name (Translated)  
Volume  
Issue  
Year 2019  
Month  
Start page  
End page  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII Article ID
 
Ichushi ID
 
Other ID
 
Doctoral dissertation
Dissertation Number  
Date of granted  
Degree name  
Degree grantor  
Abstract
本研究では、以下の3つのテーマについて、それぞれ研究成果を得た。1) クリニカルシークエンスのための脳腫瘍検体の処理、保管方法の検証⇒DIN3.0以上でシーケンス成功率100%という品質管理基準の設定に成功 2) 神経膠腫の標的遺伝子パネルの選定と、LOH検出方法の確立⇒Target amplicon sequenceにて1p19q codeletionの検出が可能なCN計測アルゴリズムの作製に成功 3) 診療情報との統合解析によるクリニカルシークエンス解析パイプラインの構築⇒ PleSSisionシステムの開発に成功
研究目的は100%達成することができた。
We performed 3 themes of research. 1) Sequence quality parameter : DIN value over 3.0 is the critical cut off for successful clinical sequence. 2) CN detection algorithm: We have developed original pipeline which enable us to detect 1p19q codeletion in glioma using even amplicon target sequence. 3) Clinical sequence pipeline integrated clinical information: We have ranched original clinical sequence system "PleSSision" which are already installed in more than 25 hospitals in Japan.
We have achieved initial goals in almost 100 %.
 
Table of contents

 
Keyword
脳腫瘍  

クリニカルシーケンス  

ゲノム解析  

個別化診断  

がんゲノム医療  

次世代シーケンサー  

分子病理  
NDC
 
Note
研究種目 : 基盤研究 (C) (一般)
研究期間 : 2017~2019
課題番号 : 17K10855
研究分野 : ゲノム病理学
 
Language
日本語  

英語  
Type of resource
text  
Genre
Research Paper  
Text version
publisher  
Related DOI
Access conditions

 
Last modified date
Mar 05, 2021 13:23:40  
Creation date
Mar 05, 2021 13:23:40  
Registerd by
mediacenter
 
History
Mar 5, 2021    インデックス を変更
 
Index
/ Public / Grants-in-Aid for Scientific Research / Fiscal year 2019 / Japan Society for the Promotion of Science
 
Related to
 

Ranking

most accessed items
1st 新自由主義に抗す... (425) 1st
2nd 斎藤隆夫の「粛軍... (342)
3rd 認知文法から考え... (263)
4th 慶應義塾図書館史... (261)
5th M&Aにおける... (249)

most downloaded items
1st <<Qu'... (1469) 1st
2nd 新参ファンと古参... (427)
3rd 731部隊と細菌戦 ... (316)
4th 新自由主義に抗す... (273)
5th 日本における美容... (259)

LINK

慶應義塾ホームページへ
慶應義塾大学メディアセンターデジタルコレクション
慶應義塾大学メディアセンター本部
慶應義塾研究者情報データベース