Item Type |
Article |
ID |
|
Preview |
Image |
|
Caption |
|
|
Full text |
KAKEN_17K10855seika.pdf
Type |
:application/pdf |
Download
|
Size |
:680.4 KB
|
Last updated |
:Mar 5, 2021 |
Downloads |
: 340 |
Total downloads since Mar 5, 2021 : 340
|
|
Release Date |
|
Title |
Title |
脳腫瘍クリニカルシークエンスの基盤作成
|
Kana |
ノウシュヨウ クリニカル シークエンス ノ キバン サクセイ
|
Romanization |
Nōshuyō kurinikaru shīkuensu no kiban sakusei
|
|
Other Title |
Title |
Clinical sequence platform for brain tumor
|
Kana |
|
Romanization |
|
|
Creator |
Name |
西原, 広史
|
Kana |
ニシハラ, ヒロシ
|
Romanization |
Nishihara, Hiroshi
|
Affiliation |
慶應義塾大学・医学部 (信濃町) ・教授
|
Affiliation (Translated) |
|
Role |
Research team head
|
Link |
科研費研究者番号 : 50322805
|
|
Edition |
|
Place |
|
Publisher |
|
Date |
Issued (from:yyyy) |
2020
|
Issued (to:yyyy) |
|
Created (yyyy-mm-dd) |
|
Updated (yyyy-mm-dd) |
|
Captured (yyyy-mm-dd) |
|
|
Physical description |
|
Source Title |
Name |
科学研究費補助金研究成果報告書
|
Name (Translated) |
|
Volume |
|
Issue |
|
Year |
2019
|
Month |
|
Start page |
|
End page |
|
|
ISSN |
|
ISBN |
|
DOI |
|
URI |
|
JaLCDOI |
|
NII Article ID |
|
Ichushi ID |
|
Other ID |
|
Doctoral dissertation |
Dissertation Number |
|
Date of granted |
|
Degree name |
|
Degree grantor |
|
|
Abstract |
本研究では、以下の3つのテーマについて、それぞれ研究成果を得た。1) クリニカルシークエンスのための脳腫瘍検体の処理、保管方法の検証⇒DIN3.0以上でシーケンス成功率100%という品質管理基準の設定に成功 2) 神経膠腫の標的遺伝子パネルの選定と、LOH検出方法の確立⇒Target amplicon sequenceにて1p19q codeletionの検出が可能なCN計測アルゴリズムの作製に成功 3) 診療情報との統合解析によるクリニカルシークエンス解析パイプラインの構築⇒ PleSSisionシステムの開発に成功
研究目的は100%達成することができた。
We performed 3 themes of research. 1) Sequence quality parameter : DIN value over 3.0 is the critical cut off for successful clinical sequence. 2) CN detection algorithm: We have developed original pipeline which enable us to detect 1p19q codeletion in glioma using even amplicon target sequence. 3) Clinical sequence pipeline integrated clinical information: We have ranched original clinical sequence system "PleSSision" which are already installed in more than 25 hospitals in Japan.
We have achieved initial goals in almost 100 %.
|
|
Table of contents |
|
Keyword |
|
NDC |
|
Note |
研究種目 : 基盤研究 (C) (一般)
研究期間 : 2017~2019
課題番号 : 17K10855
研究分野 : ゲノム病理学
|
|
Language |
|
Type of resource |
|
Genre |
|
Text version |
|
Related DOI |
|
Access conditions |
|
Last modified date |
|
Creation date |
|
Registerd by |
|
History |
|
Index |
|
Related to |
|