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2022000011-20220054  
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本文公開日
 
タイトル
タイトル 新型コロナワクチンへの応答性に関連する宿主感受性遺伝子の同定  
カナ シンガタ コロナ ワクチン エノ オウトウセイ ニ カンレンスル シュクシュ カンジュセイ イデンシ ノ ドウテイ  
ローマ字 Shingata korona wakuchin eno ōtōsei ni kanrensuru shukushu kanjusei idenshi no dōtei  
別タイトル
名前 Identification of host susceptibility genes associated with response to COVID-19 vaccines.  
カナ  
ローマ字  
著者
名前 南宮, 湖  
カナ ナムグン, ホウ  
ローマ字 Namkoong, Ho  
所属 慶應義塾大学医学部基礎教室専任講師 (有期・医学部)  
所属(翻訳)  
役割 Research team head  
外部リンク  
 
出版地
 
出版者
名前 慶應義塾大学  
カナ ケイオウ ギジュク ダイガク  
ローマ字 Keiō gijuku daigaku  
日付
出版年(from:yyyy) 2023  
出版年(to:yyyy)  
作成日(yyyy-mm-dd)  
更新日(yyyy-mm-dd)  
記録日(yyyy-mm-dd)  
形態
1 pdf  
上位タイトル
名前 学事振興資金研究成果実績報告書  
翻訳  
 
 
2022  
 
開始ページ  
終了ページ  
ISSN
 
ISBN
 
DOI
URI
JaLCDOI
NII論文ID
 
医中誌ID
 
その他ID
 
博士論文情報
学位授与番号  
学位授与年月日  
学位名  
学位授与機関  
抄録
Asian Screening Array chip(ASA chip)によりジェノタイピングして得られたデータに対し、クオリティコントロールを行った結果、新型コロナウイルスワクチン接種者2,137名における537,027 SNPのジェノタイプ データを得た。これを基に、日本人集団のリファレンスパネルを用いた遺伝型インピュテーションを行った。 得られたインピュテーションデータを用いて、ワクチン接種後の抗体価、及びT細胞性免疫を量的形質として 扱った関連解析を行ったところ、以下の領域でゲノムワイド有意水準を満たす関連を検出した。 ◯ 抗体価に関して、6番染色体 class II HLA領域(rs4959098, P = 3.1×10-12)と14番染色体 免疫グロブリン重鎖 領域(リードバリアント rs1043109及びrs193160354, P = 4.8×10-14) ◯ T細胞性免疫(CD4)に関して、6番染色体 class II HLA領域(リードバリアント rs9274659, P = 5.7×10-43) ◯ T細胞性免疫(CD4/8)に関して、6番染色体 class II HLA領域(リードバリアント rs9282156, P = 4.8×10-34) 特に、抗体価の解析で検出された14番染色体 免疫グロブリン重鎖領域のリードバリアントは、IGHG1遺伝子上のコーディング変異であり、東アジア人以外の集団ではアレル頻度0.005未満という、高度な集団特異性を示すSNPであった。
Quality control of genotyping data obtained by genotyping with the Asian Screening Array chip (ASA chip) yielded genotype data for 537,027 SNPs in 2,137 new coronavirus vaccinees. Based on this data, genotypic imputation was performed using a reference panel of the Japanese population. Using the imputation data, we performed association analysis using post-vaccination antibody titers and T-cell immunity as quantitative traits, and found associations that met the genome-wide significance level in the following areas. ◯ For antibody titer, we found associations with the chromosome 6 class II HLA region (rs4959098, P = 3.1 × 10-12) and the chromosome 14 immunoglobulin heavy chain region (lead variants rs1043109 and rs193160354, P = 4.8 × 10-14) ◯ For T-cell immunity (CD4), we found associations with the chromosome 6 class II HLA region (P = 3.1 × 10-12) and chromosome 14 immunoglobulin heavy chain region (P = 4.8 × 10-14) Chromosome 6 class II HLA region (lead variant rs9274659, P = 5.7×10-43) for T-cell immunity (CD4/8) (lead variant rs9282156, P = 4.8×10-34) The lead variant in the immunoglobulin heavy chain region of chromosome 14, a coding variant in the IGHG1 gene, is a highly population-specific SNP with an allele frequency of less than 0.005 in non-East Asian populations.
 
目次

 
キーワード
 
NDC
 
注記

 
言語
日本語  

英語  
資源タイプ
text  
ジャンル
Research Paper  
著者版フラグ
publisher  
関連DOI
アクセス条件

 
最終更新日
Jul 01, 2024 14:26:20  
作成日
Jul 01, 2024 14:26:20  
所有者
mediacenter
 
更新履歴
Jul 1, 2024    インデックス を変更
 
インデックス
/ Public / 塾内助成報告書 / 学事振興資金研究成果実績報告書 / 2022年度
 
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